מטרת החוקרים היתה לבחון את הפרופיל האפיגנטי והטרנסקריפטומי של וירוס האפשטיין בר (Epstein-Barr virus - EBV) ושל לימפומות ראשוניות במערכת העצבים המרכזית (primary CNS lymphomas - PCNSL).
עוד בעניין דומה
EBV+,יEBV- ו-PCNSL נושאים מוטציות מובהקות, אך הפרופילים הטרנסקריפטומיים והאפיגנטיים שלהם לא שולבו והושוו. עובדה זו מונעת תובנות נוספות לגבי פתוביולוגיה והבדלים מולקולריים, הרלוונטיים לסיווג ולטיפול ממוקד.
לאחרונה, פורסמו בכתב העת Neuro-Oncology, ממצאיו של מחקר בו חוקרים ביקשו להעריך את הפרופיל האפיגנטי והטרנסקריפטומי של EBV ושל PCNSL.
23-EBV ו-15 EBV+ PCNSL, מסווגים מבחינה היסטולוגית כלימפומות מפוזרות של תאי B גדולים, היו נתונים לריצוף RNA ולמערכי מתילציה. בוצעה אנליזת אשכולות. זוהו ושולבו גנים בעלי ביטוי ומתילציה דיפרנציאליים.
תוצאות המחקר הדגימו שנמצאו שני אשכולות טרנסקריפטומיים נפרדים, שהפרידו בין EBV- ל-EBV+PCNSLי(p < 0.0001). הטרנסקריפטום של EBV+ הכיל גנים (GPR15, FCER2/CD23, SLAMF1/CD150) המווסתים באופן הדוק על ידי אונקוגנים של EBV בתאי B.
אנליזה נוספת של המסלול חשפה רצפטור מוגבר של תאי Bי(BCR) ואיתות WNT/beta-catenin בלימפומות EBV, בעוד שבנתיבי מחזור החיים של Interleukin-10,יNOTCH ו-Viral עברו רגולציה ביתר ב-EBV+PCNSL. בהתאם, פעילות SYK kinase הקשורה ל-BCR הועשרה בגידולי EBV בעוד ש-JAK2 הופעל יתר על המידה ב-EBV+PCNSL.
פרופיל אפיגנטי חשף מתילציה מופחתת של פרומוטור ב-EBV+PCNSL. זוהו שני אשכולות מתילציה, שהפרידו בין EBV ל-EBV+PCNSLי(p < 0.0001).
פרופילים אפיגנטיים היו שונים מ-2,788 גידולי מוח אחרים ודגימות התייחסות לא ממאירות. היפר-מתילציה של אזור הפרומוטור של CD79B, תת-יחידת BCR קריטית לשגשוג מתמשך במחלת EBV, בקורלציה גבוהה (R = -0.7) עם הורדת הטרנסקריפטום שלה ב-EBV+PCNSL.
החוקרים הסיקו כי EBV+ ו-EBV-PCNSL מכילים פרופילים טרנסקריפטומיים ואפיגנטיים שונים, המאששים אותם כתת סוגים ביולוגיים ייחודיים. הבדלים שנחשפו מספקים תובנות חדשות לגבי הפתוביולוגיה שלהם, עשויים להנחות אבחון מולקולרי וטיפולים ממוקדים.
מקור:
הירשמו לקבלת עדכונים בנושאים שעלו בכתבה
תגובות אחרונות